间苯二甲酸和二咪唑基苯构建锌化合物的合成, 晶体结构和荧光性质

由水热法合成了锌化合物[Zn₂(dib)(1,3-BDC)₂(H₂O)](1),1,3-H₂BDC=间苯二甲酸,dib=1,4-二咪唑基苯),并进行了元素分析、IR、TG及X-射线衍射法表征。晶体结构表明:配合物1属于单斜晶系,P2₁/n空间群。配合物1是由羧酸配体间苯二甲酸阴离子连接成一维双链,然后由1,4-二咪唑基苯连接成层状,此二维结构被氢键拓展成三维超分子结构。     

Investigation of Scrambled Ions in Tandem Mass Spectra, Part 2. On the Influence of the Ions on Peptide Identification

A comprehensive investigation was performed to understand the influence of sequence scrambling in peptide ions on peptide identification results. To achieve this, four tandem mass spectrometry datasets with scrambled ions included and with them excluded were analyzed by Crux, X!Tandem, SpectraST, Lutefisk, and PepNovo. While the different algorithms differed in their performance, an increase in the number of correctly identified peptides was generally observed when removing scrambled ions, with the exception of the SpectraST algorithm. However, the variation of the match scores upon removal was unpredictable. Following these investigations, an interpretation was given on how the scrambled ions affect peptide identification. Lastly, a simulated theoretical mass spectral library derived from the NIST peptide Libraries was constructed and searched by SpectraST to study whether scrambled ions in predicted mass spectra could affect peptide identification. Consistent with the peptide library search results, no significant variations for dot product scores as well as peptide identification results were observed when these ions were included in the theoretical MS/MS spectra. From the five adopted algorithms, the SpectraST and Crux provided the most robust results, whereas X!Tandem, PepNovo, and Lutefisk were sensitive to the existence of the scrambled ions, especially the latter two de novo sequencing algorithms.      

Theoretical Investigation on the Absence of Spore Photoproduct Analogue at Cytosine-Thymine Site

As a well known DNA photolesion product, the special UV induced pyrimidine dimmer called spore photoproduct （SP）, has aroused strong research interests. The SP formation was reported solely between two adjacent thymidine residues. It remains unclear in pervious experimental observations why there is an absence of the cytosine-derived SP-like photoprod- uct formation at the cytosine containing DNA strand, although the cytosine residue holds great similarity to thymine in terms of molecular structure. From a theoretical perspec- tive, we have explored this issue in this work by means of density functional theory at the B3LYP/6-311＋＋G（d,p） //B3LYP/6-31G（d,p） level for the DNA dinucleotide fragment, cy- tosine phosphate thymine （CpT）. Key factors blocking the formation of the SP-like product between two adjacent cytosine and thymidine residues are revealed. Instead of undergoing photochemical SP reaction, a photophysical deactivation pathway back to the ground state turns out to be favorable for the CpT dinucleotide fragment.     

含2,2′,4-三(2-氯苯基)-5-(3,4-二甲氧基苯基)-4′,5′-二苯基-1,1′-双咪唑光引发体系的光聚合动力学研究

2,2′,4-三(2-氯苯基)-5-(3,4-二甲氧基苯基)-4′,5′-二苯基-1,1′-二咪唑(CZ-HABI)是一种高效的光引发剂,其结构通过傅里叶红外光谱仪、核磁共振仪、紫外吸收光谱进行表征.复合引发体系(PI)由光引发剂CZ-HABI、增感剂4,4′-双(二乙氨基)苯甲酮(EMK)、供氢体N-苯基甘氨酸(NPG)组成,利用实时红外(RT-IR)对该复合光引发体系进行了光聚合反应动力学研究,结果表明:在没有供氢体条件下,基本上没有引发效果,增加供氢体后,引发效率大幅增加;增加复合光引发体系用量能提高光聚合反应的双键转化率,且最大聚合速率与[PI]1/2成正比;随着光强的增强,单体的双键转化率与最大反应速率均增大;复合光引发体系引发双丙烯酸酯类单体的最终双键转化率比三丙烯酸酯类单体要高.复合光引发体系的引发效率比ITX/EDAB光引发体系的引发效率高,与1-羟基环己基苯基甲酮(184)、2-羟基-2-甲基-1-苯基-1-丙酮(1173)的引发效果相近.     

基于超高效液相色谱-离子阱-飞行时间质谱联用的白血病细胞及耐药细胞非靶标代谢组学研究

建立了一种基于超高效液相色谱-离子阱-飞行时间质谱(UPLC-IT-TOF MS)联用的非靶标代谢组学方法,研究了人慢性髓系白血病细胞及其阿霉素耐药细胞(K562和K562-ADM)之间的代谢物差异。考察了细胞破碎方法、提取溶剂体系和溶剂体积对细胞代谢物提取效果的影响,实验发现采用超声破碎法,以800μL的80%甲醇提取时可得到较多的代谢特征峰,方法重复性和稳定性较高。将建立的方法应用于K562及K562-ADM细胞的代谢组差异研究,对所得数据进行主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)。结果显示2种细胞的代谢特征存在显著差异,并发现40个对分类有显著贡献的代谢物,差异代谢物主要参与氨基酸代谢、鞘脂代谢、嘌呤代谢和嘧啶代谢等通路。该方法可用于K562和K562-ADM细胞的代谢组差异研究,可望为白血病细胞耐药性的代谢组学研究提供帮助。     

4-羟基香豆素的合成及晶体结构

以2-羟基苯乙酮、碳酸二乙酯为起始原料,NaH的作用下,合成了4-羟基香豆素,并通过红外光谱、核磁共振光谱以及X-射线单晶衍射对其进行了结构表征。结果表明:4-羟基香豆素是一个中性分子,每个晶胞里含有8个4-羟基香豆素分子。该化合物分子中存在丰富的氢键作用力,存在着以H1A和H5A为受体与O2形成的双叉氢键相互作用,并且通过双叉氢键形成一维链状结构。链与链之间再进一步通过经典的O-H···O双重氢键自组装成二维网络结构,从而形成结构规则的白色晶体。     

新型神经氨酸酶抑制剂的设计合成及抗流感病毒活性

对上市药物扎那米韦、 奥司他韦和帕拉米韦进行结构修饰, 对化合物相应的氨基进行磷酰化, 设计合成了10个新化合物. 新化合物在酶水平和细胞水平均具有一定的抗流感病毒活性, 化合物I-8在酶水平、 化合物I-6在细胞水平具有和阳性对照药奥司他韦相当的活性.     

镍掺杂对Fe催化剂上CO_2加氢制烃影响的理论计算研究

为研究镍掺杂对铁基催化剂上二氧化碳加氢生成C_1和C_2烃类产物的影响,应用密度泛函理论进行了相关计算.在Fe(110)和Ni-Fe(110)表面上, CH~*物种是最有利的生成CH_4和C_2H_4的C_1物种(CH_x~*),其最可能的生成路径为CO_2→HCOO~*→HCO~*→CH~*.尽管CO_2直接解离为CO~*在动力学上相较于加氢生成HCOO~*和COOH~*是较为有利的,但CO~*进一步加氢生成HCO~*在能量上是不利的,其倾向于逆向解离回到CO~*. CH~*物种可以通过三步加氢反应生成CH_4或者经C—C耦合及两步加氢生成C_2H_4.在Fe(110)表面上,对甲烷和乙烯产物选择性起决定作用的基元反应能垒之间差异仅为0.10 eV,因此两者选择性相近.在将Ni原子引入Fe(110)表面后,生成甲烷与乙烯的选择性差异变大,导致乙烯的选择性提高.计算结果表明,添加少量金属Ni能够促进CO_2转化为CH~*,及两个CH~*物种发生C—C耦合和进一步加氢转化为乙烯.     

基于手性MOF与乙炔黑修饰电极对多巴胺和尿酸的同时检测（英文）

采用具有一维手性通道的手性金属有机框架HMOF-Zn与乙炔黑共混复合作为修饰材料改性玻碳电极(HMOF-Zn@AB-Nafion-GCE)。并将复合后的电极对多巴胺(DA)和尿酸(UA)进行同时检测。实验结果表明,HMOF-Zn@AB-Nafion-GCE传感器对UA和DA具有高的灵敏度和良好的选择性,且HMOF-Zn@AB-Nafion-GCE传感器表现出对DA比对UA更高的灵敏度。HMOF-Zn@AB-Nafion-GCE传感器对DA和UA的高灵敏度和高选择性是因为HMOF-Zn有较大的比表面积,同时存在丰富的氢键,在高导电剂乙炔黑的协同作用下能增大电子传递。此外,所制备的传感器在优化条件下对DA和UA均表现出优异的线性响应,DA检测范围为0.15~2.5μmol·L^-1,UA检测范围为0.2~4μmol·L^-1,检出限(S/N=3)分别为0.003和0.02μmol·L^-1,重现性良好。该传感器还成功应用于测定人体尿液中UA和多巴胺盐酸盐注射液中的DA。     

生物制造不同立体构型2,3-丁二醇:合成机理与实现方法

总结了不同2,3-丁二醇立体异构体的生物合成机制,以及有利于这些立体异构体高效合成的一些策略,包括构建全细胞催化剂及利用合成生物学技术重建代谢途径等先进方法;同时指出,未来的研究重点是进一步利用合成生物学的方法,以提高不同立体构型2,3-丁二醇的生物合成能力,并建立这些异构体高效可行的分离方法.