| 一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用 |
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| 引用本文： | 梅虎,周原,孙立力,李志良. 一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用[J]. 物理化学学报, 2004, 20(8): 821-825. DOI: 10.3866/PKU.WHXB20040808 |
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| 作者姓名： | 梅虎 周原 孙立力 李志良 |
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| 作者单位： | College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University;Key Laboratory of Biomedical Engineering of Educational Ministry and Chongqing City;College of Bioengineering, Chongqing University, Chongqing 400044 |
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| 基金项目： | 重庆市应用基础基金(2001-155403-6)，霍英东基金(98-05-26)，重庆大学创新基地科技攻关实践项目(2003-03)资助~~ |
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| 摘 要： | 从天然氨基酸的25个结构与拓扑变量中经主成分分析得到一种新的氨基酸描述子——VSTV （principal component scores vector of structural and topological variables）.应用该描述子对以下3个体系,即血管紧张素转化酶抑制剂（2肽）、抗菌18肽和促凝血酶原激酶抑制剂（6～12肽）进行分子结构参数化表达,并在此基础上通过偏最小二乘回归(PLSR)建立定量构效关系(QSAR)模型,取得了优于文献的结果.模型的复相关系数（R2）和交互检验复相关系数（Q2）分别为0.789, 0.767; 0.996, 0.879; 0.981, 0.480.
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| 关 键 词： | 氨基酸 多肽 拓扑 VSTV 定量构效关系 偏最小二乘回归 |
| 收稿时间： | 2003-12-25 |
| 修稿时间： | 2003-12-25 |
A New Descriptor of Amino Acids and Its Application in Peptide QSAR |
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| Mei Hu,, Zhou Yuan, Sun Li-Li, Li Zhi-Liang. A New Descriptor of Amino Acids and Its Application in Peptide QSAR[J]. Acta Physico-Chimica Sinica, 2004, 20(8): 821-825. DOI: 10.3866/PKU.WHXB20040808 |
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| Authors: | Mei Hu Zhou Yuan Sun Li-Li Li Zhi-Liang |
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| Affiliation: | College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University;Key Laboratory of Biomedical Engineering of Educational Ministry and Chongqing City;College of Bioengineering, Chongqing University, Chongqing 400044 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Amino acids Peptide Topology Principal component scores vector of structural and topological variables (VSTV) Quantitative structure activity relationship Partial least squares regression |
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