| 分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响 |
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| 引用本文： | 康文渊,徐锡明,郭建秀,田菲菲.分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响[J].化学通报,2017,80(2):179-184,207. |
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| 作者姓名： | 康文渊 徐锡明 郭建秀 田菲菲 |
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| 作者单位： | 西南交通大学生命科学与工程学院,Pathogenesis of vascular infections unit,INSERM,Institut Pasteur,西南交通大学生命科学与工程学院,西南交通大学生命科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31601066、11671329);中央高校基本科研业务费专项资金（2682015CX051）;西南交通大学青年教师百人计划（2682013BR022） |
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| 摘 要： | 芳香烃受体(Aryl hydrocarbon receptor,AhR)属于配体依赖性的转录因子蛋白。本文通过对AhR配体结合区域(Ligand binding domain,LBD)的结构功能及物种特异性分析,发现在其结合腔口有一些关键残基可能起到"门控"作用,进一步将野生型(WT)和3个突变模型(Phe289Ala、Tyr316Ala、Ile319Ala)进行分子动力学模拟,从蛋白稳定性、蛋白结构变化、蛋白结合腔变化及蛋白和配体结合能力4个方面分析3个残基的门控作用。研究发现,Phe289、Tyr316、Ile319氨基酸残基通过形成疏水作用为AhR LBD起到"门控"作用;而将这些氨基酸分别突变后,其蛋白稳定性降低,整体运动性增加,配体亲和力减弱,其中Tyr316、Ile319对腔内体积影响较大,Phe289使腔内环境稳定性降低。本研究可为基于芳香烃受体的药物设计提供相关理论指导。
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| 关 键 词： | 分子模拟 分子动力学 突变 芳香烃受体 |
| 收稿时间： | 2016/7/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/8/18 0:00:00 |
Molecular Dynamics Studies on the Structure of Aryl hydrocarbon receptor Fragment Affected by Site-Directed Mutagenesis |
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| Kang Wenyuan,Xu Ximing,Guo Jianxiu and Tian Feifei.Molecular Dynamics Studies on the Structure of Aryl hydrocarbon receptor Fragment Affected by Site-Directed Mutagenesis[J].Chemistry,2017,80(2):179-184,207. |
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| Authors: | Kang Wenyuan Xu Ximing Guo Jianxiu and Tian Feifei |
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| Institution: | southwest jiaotong university,,, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Molecular Simulation Molecular Dynamics Mutation Aryl hydrocarbon receptor |
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