| 最短α-螺旋的理论研究 |
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| 作者姓名： | 蒋帆 吴云东 |
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| 作者单位： | 北京大学深圳研究生院,化学基因组学实验室,深圳,518055香港科技大学化学系,香港;北京大学深圳研究生院,化学基因组学实验室,深圳,518055香港科技大学化学系,香港 |
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| 基金项目： | Research Grants Council ofHong Kong ， 国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 在B3LYP/6-31+G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋. 计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好. 类似于一般的较长α-螺旋, 观察到了C-端的散开. 对很短的聚丙氨酸肽链, 从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋稳定, 然而熵效应不利于310-螺旋结构. 螺旋N2(N-端第二个残基)位上天冬氨酸侧链的加盖(Capping)效应明显使α-螺旋相对310-螺旋更加稳定. 因而, 在同样长度下α-螺旋比310-螺旋多的统计结果能够被理解. 另外, 最短的α-螺旋的C-端倾向于以β-转角结构结束.
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| 关 键 词： | α-螺旋 310螺旋 密度泛函理论(DFT)计算 氧键加盖 |
| 收稿时间： | 2008-11-06 |
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