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基于氨基酸描述符SVHEHS的ACE抑制肽QSAR研究
引用本文:刘静,管骁,彭剑秋. 基于氨基酸描述符SVHEHS的ACE抑制肽QSAR研究[J]. 化学学报, 2012, 70(1): 83-91. DOI: 10.6023/A1107012
作者姓名:刘静  管骁  彭剑秋
作者单位:a. 江南大学食品科学与技术国家重点实验室, 无锡 214122;b. 上海海事大学信息工程学院, 上海 201306;c. 上海理工大学医疗器械与食品学院, 上海 200093
基金项目:国家自然科学基金,上海市晨光计划项目,江南大学食品科学与技术国家重点实验室开放课题资助课题
摘    要:收集20种天然氨基酸的457种理化性质,按照疏水、电性特征、氢键贡献和立体特征分类后,对它们分别进行主成分分析(Principal component analysis,PCA),得到一个新的氨基酸残基结构描述符SVHEHS.用该描述符分别对血管紧张素转化酶(AngiotensinⅠconverting enzyme,ACE)抑制二肽、三肽、四肽进行序列表征,并用来与生物活性建立偏最小二乘(Partial least square regression,PLS)模型.ACE抑制二肽、三肽、四肽模型的相关系数、交叉验证相关系数、 均方根误差、外部验证相关系数分别为0.607,0.507,0.587,0.783;0.852,0.813,0.232,0.839;1,1,0,0.935.由此说明,采用SVHEHS描述符建立的PLS模型拟合、预测能力均较好,可用于血管紧张素转化酶抑制肽的定量构效关系研究.

关 键 词:氨基酸描述符  血管紧张素转化酶抑制肽  偏最小二乘  定量构效关系  

QSAR Study on ACE Inhibitory Peptides Based on Amino Acids Descriptor SHVHES
Liu Jing,Guan Xiao,Peng Jianqiu. QSAR Study on ACE Inhibitory Peptides Based on Amino Acids Descriptor SHVHES[J]. Acta Chimica Sinica, 2012, 70(1): 83-91. DOI: 10.6023/A1107012
Authors:Liu Jing  Guan Xiao  Peng Jianqiu
Affiliation:a. State Key Laboratory of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi 214122;b. College of Information Engineering, Shanghai Maritime University, Shanghai 201306;c. School of Medical Instrument and Food Engineering, University of Shanghai for Science and Technology, Shanghai 200093
Abstract:
Keywords:
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