| 人工神经网络-紫外光谱法短串联重复序列基因分型检测 |
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| 引用本文： | 汪雪娇,牟红元,鲁辉,豆兴茹,邱婷,谢洪平. 人工神经网络-紫外光谱法短串联重复序列基因分型检测[J]. 分析化学, 2011, 0(11): 1701-1705 |
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| 作者姓名： | 汪雪娇 牟红元 鲁辉 豆兴茹 邱婷 谢洪平 |
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| 作者单位： | 苏州大学医学部药学院 |
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| 摘 要： | 以STR基因座D16S539中的总核心重复串数相差较小的10-11,10-12,11-11和10-13基因型为研究对象,以紫外光谱为判别变量,建立了以人工神经网络(ANN)提取富信息变量为基础的ANN基因分型方法。在优化条件下,对4个基因型样本进行了聚合酶链式反应扩增,以扩增样本在200~310 nm范围内的检测光谱进行预处理和偶合的ANN-ANN网络优化。结果表明,提取富信息变量和基因分型的ANN的最优网络结构分别为391-50-391和50-6-4,该结构下的判别模型的校正相对均方根误差(RMS)和预测RMS分别是0.0279和0.0418,模型表现出了良好的稳健性和100%的基因型正确预测率。成功实现了基于紫外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测。
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| 关 键 词： | 短串联重复序列 紫外光谱 人工神经网络 基因分型 |
Genotyping of Short Tandem Repeat Based on Ultraviolet Spectroscopy Combined with Artificial Neural Network |
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| WANG Xue-Jiao,MOU Hong-Yuan,LU Hui,DOU Xing-Ru,QIU Ting,XIE Hong-Ping. Genotyping of Short Tandem Repeat Based on Ultraviolet Spectroscopy Combined with Artificial Neural Network[J]. Chinese Journal of Analytical Chemistry, 2011, 0(11): 1701-1705 |
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| Authors: | WANG Xue-Jiao MOU Hong-Yuan LU Hui DOU Xing-Ru QIU Ting XIE Hong-Ping |
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| Affiliation: | (College of Pharmaceutical Sciences,Soochow University,Suzhou 215123) |
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| Abstract: | |
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