| HLA-A*0201限制性CTL表位定量结构与活性研究 |
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| 引用本文： | 梅虎,周原,廖志华,李志良. HLA-A*0201限制性CTL表位定量结构与活性研究[J]. 化学学报, 2006, 64(9): 949-952 |
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| 作者姓名： | 梅虎 周原 廖志华 李志良 |
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| 作者单位： | 重庆大学化学化工学院;重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆,400044;重庆大学化学化工学院;西南师范大学生命科学学院,重庆,400715 |
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| 基金项目： | 重庆大学校科研和校改项目 |
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| 摘 要： | 采用VHSE氨基酸结构描述子表征HLA-A*0201限制性表位结构, 以遗传算法和偏最小二乘相结合(GA-PLS)对102个训练集进行定量构效关系建模. 剔除3个异常样本后, 据候选模型交互检验及50个外部测试集预测结果, 筛选得到最优偏最小二乘模型(A＝2), 其R2, Q2和 分别为0.755, 0.621和0.680. 构效研究显示: CTL表位活性主要与1, 2, 7, 8, 9位氨基酸残基疏水、1, 2位立体及6位残基电性等性质密切相关.
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| 关 键 词： | 细胞毒T细胞 表位 定量构效关系 遗传算法 偏最小二乘 |
| 收稿时间： | 2004-12-08 |
| 修稿时间： | 2004-12-082006-01-19 |
Study on Quantitative Structure-Activity Relationships of HLA-A*0201 Restrictive CTL Epitopes |
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| MEI Hu,ZHOU Yuan,LIAO Zhi-Hua,LI Zhi-Liang. Study on Quantitative Structure-Activity Relationships of HLA-A*0201 Restrictive CTL Epitopes[J]. Acta Chimica Sinica, 2006, 64(9): 949-952 |
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| Authors: | MEI Hu ZHOU Yuan LIAO Zhi-Hua LI Zhi-Liang |
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| Affiliation: | (1 College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University, 2 Key Laboratory of Biomedical Engineering of Both Ministry of Education of China and Chongqing City, Chongqing 400044)(3 School of Life Sciences, Southwest Normal University, Chongqing 400715) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cytotoxic T lymphocyte epitope quantitative structure-activity relationship genetic algorithm partial least squares |
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