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HLA-A*0201限制性CTL表位定量结构与活性研究
引用本文:梅虎,周原,廖志华,李志良.HLA-A*0201限制性CTL表位定量结构与活性研究[J].化学学报,2006,64(9):949-952.
作者姓名:梅虎  周原  廖志华  李志良
作者单位:1. 重庆大学化学化工学院;重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆,400044
2. 重庆大学化学化工学院
3. 西南师范大学生命科学学院,重庆,400715
基金项目:重庆大学校科研和校改项目
摘    要:采用VHSE氨基酸结构描述子表征HLA-A*0201限制性表位结构, 以遗传算法和偏最小二乘相结合(GA-PLS)对102个训练集进行定量构效关系建模. 剔除3个异常样本后, 据候选模型交互检验及50个外部测试集预测结果, 筛选得到最优偏最小二乘模型(A=2), 其R2, Q2和 分别为0.755, 0.621和0.680. 构效研究显示: CTL表位活性主要与1, 2, 7, 8, 9位氨基酸残基疏水、1, 2位立体及6位残基电性等性质密切相关.

关 键 词:细胞毒T细胞  表位  定量构效关系  遗传算法  偏最小二乘
收稿时间:12 8 2004 12:00AM
修稿时间:2004-12-082006-01-19

Study on Quantitative Structure-Activity Relationships of HLA-A*0201 Restrictive CTL Epitopes
MEI Hu,ZHOU Yuan,LIAO Zhi-Hua,LI Zhi-Liang.Study on Quantitative Structure-Activity Relationships of HLA-A*0201 Restrictive CTL Epitopes[J].Acta Chimica Sinica,2006,64(9):949-952.
Authors:MEI Hu  ZHOU Yuan  LIAO Zhi-Hua  LI Zhi-Liang
Institution:1 College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University;2 Key Laboratory of Biomedical Engineering of Both Ministry of Education of China and Chongqing City, Chongqing 400044;3 School of Life Sciences, Southwest Normal University, Chongqing 400715
Abstract:
Keywords:cytotoxic T lymphocyte  epitope  quantitative structure-activity relationship  genetic algorithm  partial least squares
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