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PKA酶及其抑制剂balanol的计算化学*
引用本文:金海晓 严小军 朱鹏. PKA酶及其抑制剂balanol的计算化学*[J]. 化学进展, 2010, 22(5): 993-1001
作者姓名:金海晓 严小军 朱鹏
作者单位:(宁波大学海洋生物工程重点实验室 宁波315211)
摘    要:蛋白激酶通过磷酸化蛋白底物来调节细胞内的信号转导途径,是重要的药物设计靶标。蛋白激酶A(PKA)是最早获得催化结构域X衍射晶体结构的激酶,是蛋白激酶家族中代表性结构。本文综述了PKA在计算化学领域的研究进展,包括PKA全酶以及它的催化(C)亚基和调节(R)亚基在水溶液中的分子动力学模拟研究,磷酰基转移机理和C亚基与其抑制剂balanol的结合自由能预测、柔性对接。分子动力学、分子对接、同源模建、QM/MM等计算机辅助设计方法在该体系中得到运用。

关 键 词:蛋白激酶A(PKA)  balanol  分子动力学模拟  分子对接  QM/MM  
收稿时间:2009-08-17
修稿时间:2009-11-10

Computational Chemistryof Protein Kinase A and Its Inhibitor Balanol
Affiliation:(Key Laboratory of Marine Biotechnology, Ningbo University, Ningbo 315211, China)
Abstract:
Keywords:protein kinase A (PKA)  balanol  molecular dynamics simulation  dock  QM/MM  
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