PKA酶及其抑制剂balanol的计算化学* |
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引用本文: | 金海晓 严小军 朱鹏. PKA酶及其抑制剂balanol的计算化学*[J]. 化学进展, 2010, 22(5): 993-1001 |
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作者姓名: | 金海晓 严小军 朱鹏 |
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作者单位: | (宁波大学海洋生物工程重点实验室 宁波315211) |
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摘 要: | 蛋白激酶通过磷酸化蛋白底物来调节细胞内的信号转导途径,是重要的药物设计靶标。蛋白激酶A(PKA)是最早获得催化结构域X衍射晶体结构的激酶,是蛋白激酶家族中代表性结构。本文综述了PKA在计算化学领域的研究进展,包括PKA全酶以及它的催化(C)亚基和调节(R)亚基在水溶液中的分子动力学模拟研究,磷酰基转移机理和C亚基与其抑制剂balanol的结合自由能预测、柔性对接。分子动力学、分子对接、同源模建、QM/MM等计算机辅助设计方法在该体系中得到运用。
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关 键 词: | 蛋白激酶A(PKA) balanol 分子动力学模拟 分子对接 QM/MM |
收稿时间: | 2009-08-17 |
修稿时间: | 2009-11-10 |
Computational Chemistryof Protein Kinase A and Its Inhibitor Balanol |
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Affiliation: | (Key Laboratory of Marine Biotechnology, Ningbo University, Ningbo 315211, China) |
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Abstract: | |
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Keywords: | protein kinase A (PKA) balanol molecular dynamics simulation dock QM/MM |
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