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江西7种蛇类基于16S rRNA基因的DNA条形码构建
引用本文:邓立彬,汤晓丽,邵建明,熊志勇,熊家强,熊丹群,方进,龙飞,陈极光,肖俐,汪雁.江西7种蛇类基于16S rRNA基因的DNA条形码构建[J].南昌大学学报(理科版),2011,35(1).
作者姓名:邓立彬  汤晓丽  邵建明  熊志勇  熊家强  熊丹群  方进  龙飞  陈极光  肖俐  汪雁
作者单位:1. 南昌大学,基础医学院,江西,南昌,330006;中国科学院北京基因组研究所,北京,100029
2. 南昌大学,基础医学院,江西,南昌,330006
3. 中国科学院北京基因组研究所,北京,100029
4. 南昌大学,第一临床医学院,江西,南昌,330006
5. 南昌大学,医学实验教学部,江西,南昌,330006
基金项目:国家自然科学基金资助项目,南昌大学科研基金资助项目,南昌大学大学生创新性实验计划项目
摘    要:采用新设计CO1、16S、CR3种线粒体基因(位点)的简并引物,对江西地区常见蛇类(2科6属7种)共20个个体样本进行了DNA条形码分析的初步尝试,将实验结果结合GenBank部分蛇类序列数据分析表明,在本实验涉及的蛇类个体及类群的识别上,16S rRNA基因片段合乎通用条码标记的序列的要求;且本实验设计的16S简并引物有适用性强、宽容度大的优势.其次,本研究结果支持"16S rRNA基因至少应该作为脊椎动物标准条码标记--线粒体COI基因不可缺少的补充"观点;提示当前对DNA条形码在不同生物类群的应用方面,尚待在更大的标本样品数量及更多不同基因片段序列数据的支撑.

关 键 词:16S  rRNA基因  蛇类  DNA条形码

Initially study of the 16 S rRNA gene in DNA barcoding for snakes from JIANGXI
DENG Li-bin,TANG Xiao-li,SHAO Jian-ming,XIONG Zhi-yong,XIONG Jia-qiang,XIONG Dan-qun,FANG Jing,LONG Fei,CHEN Ji-guang,XIAO Li,WANG Yan.Initially study of the 16 S rRNA gene in DNA barcoding for snakes from JIANGXI[J].Journal of Nanchang University(Natural Science),2011,35(1).
Authors:DENG Li-bin  TANG Xiao-li  SHAO Jian-ming  XIONG Zhi-yong  XIONG Jia-qiang  XIONG Dan-qun  FANG Jing  LONG Fei  CHEN Ji-guang  XIAO Li  WANG Yan
Institution:DENG Li-bin1b,2,TANG Xiao-li1b,SHAO Jian-ming2,XIONG Zhi-yong1c,XIONG Dan-qun1c,FANG Jing1a,LONG Fei1a,CHEN Ji-guang1a,XIAO Li1a,WANG Yan1a (1a.Faculty of Basic Medical Science,1b.First Clinical Medical College,1c.Laboratory Center of Medicine,Nanchang University,Nanchang 330006,China,2.Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100029,China)
Abstract:Referred to snake sequence data from GenBank,and studied 20 samples of snakes in Nanchang,which include 2 families,6 genus,and 7 species,to present a first attempt in applying the usage of DNA barcode in the species of snakes.Our experiment demonstrates,in terms of identifying snakes samples or groups,mitochondrial 16S rRNA gene fulfills the requirements for a universal DNA barcoding marker;we also show certain advantage in the application and universality of combination.Furthermore,our result supports the ...
Keywords:16S rRNA gene  snake  DNA barcoding  
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