|
|||||
|
|
| 抑制剂BD2对PKA与PKC βII的抑制选择性研究 | |
| 作者姓名： | 金海晓a 吴天星 b 严小军a 蒋勇军c 邹建卫c |
| 作者单位： | (a宁波大学海洋生物工程重点实验室 宁波 315211) ;(b浙江大学化学系 杭州 310027) ;(c浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室 宁波 315100) ; |
| 摘 要： | 蛋白激酶A (PKA)和蛋白激酶C (PKC)的过度表达导致细胞生长分化异常, 是治疗肿瘤的潜在靶点. 抑制剂BD2对PKA和PKC抑制作用存在高选择性. 为了探讨BD2高选择性机制, 本工作以PKA与BD2复合物的晶体结构为模板, 通过同源模建结合分子对接的方法构建PKC βII与BD2复合物的结构, 并对PKA-BD2复合物和PKC-BD2复合物进行了2.5 ns的分子动力学模拟, 运用MM-GBSA方法计算了结合自由能, 通过能量分解的方法考察PKA和PKC的主要残基与BD2之间的相互作用和识别机制. 结合能分析结果很好地描述了BD2对PKA抑制活性比其对PKC抑制活性高这一实验现象. 氢键分析和能量分解结果共同说明了BD2的B环和酰胺链部分与PKA和PKC中相应位点的残基之间的相互作用存在差异, 这是BD2存在选择性的内在因素. BD2高选择性作用机制的阐明为进一步基于结构的balanol类抑制剂的结构设计和优化提供了合理的指导. |
| 关 键 词： | 蛋白激酶A (PKA) 蛋白激酶C (PKC) 同源模建 分子对接 分子动力学模拟 抑制选择性 |
| 收稿时间： | 2008-07-08 |
| 修稿时间： | 2008-12-15 |
| 点击此处可从《化学学报》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《化学学报》下载全文 | |