| 融合PPI和基因表达数据的关键蛋白质识别方法 |
| |
| 引用本文： | 李敏,张含会,费耀平.融合PPI和基因表达数据的关键蛋白质识别方法[J].中南大学学报(自然科学版),2013,44(3). |
| |
| 作者姓名： | 李敏 张含会 费耀平 |
| |
| 作者单位： | 中南大学信息科学与工程学院,湖南长沙,410083 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，高等学校博士点专项基金资助项目，湖南省科技计划项目 |
| |
| 摘 要： | 提出一种新的融合了基因表达数据和PPI网络的拓扑特性来识别关键蛋白质的中心性测度PeC.对于网络中的每一条边,PeC首先计算该边的聚集系数和该边相连的2个基因(蛋白质)共表达的皮尔逊相关系数,并在此基础上进一步计算出该边的权值.网络中每个节点的PeC值即为其所连接的所有边的权值之和.基于酵母PPI网络上的实验结果表明,PeC明显优于其他8种中心性拓扑参数DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC和SoECC;特别地,在预测的蛋白质数量不大于总数量的10％的情况下,PeC的预测准确率相对于SC,CC和EC提高20％以上.
|
| 关 键 词： | 关键蛋白质 蛋白质相互作用网络 基因表达 边聚集系数 皮尔逊相关系数 |
Essential protein discovery method based on integration of PPI and gene expression data |
| |
| LI Min
,
ZHANG Hanhui
,
FEI Yaoping.Essential protein discovery method based on integration of PPI and gene expression data[J].Journal of Central South University:Science and Technology,2013,44(3). |
| |
| Authors: | LI Min ZHANG Hanhui FEI Yaoping |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
