Computer simulation of water-plastocyanin interaction energy

Summary We have used a computer simulation method to calculate the interaction energy between water and a copper-containing protein, plastocyanin. The isoenergy maps obtained provide useful information on the hydration layer around the biomolecule. This method, furthermore, also leads to an estimation (6.4 ?) of the distance between the Cu²⁺ ion bound to plastocyanin and the nearest water molecule; on this basis we could rule out the possibility of the direct accessibility of water to the Cu²⁺ ion.

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Riassunto Si è usato un metodo di simulazione al calcolatore per calcolare l'energia d'interazione fra l'acqua ed una proteina contenente rame, la plastocianina. Le mappe iso-energetiche che ottenute forniscono informazioni utili sullo strato d'idratazione della biomolecola. Il metodo ha inoltre portato ad una stima (6.4 ?) della distanza fra lo ione Cu²⁺ legato alla plastocianina e la molecola d'acqua piú vicina; sulla base di questo risultato si esclude la possibilità di una diretta accessibilità dello ione Cu²⁺ all'acqua.