| 基于偶合人工神经网络的近红外光谱对D5S818基因座的分型 |
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| 引用本文： | 郭莉萍,汪雪娇,豆兴茹,邱婷,谢洪平. 基于偶合人工神经网络的近红外光谱对D5S818基因座的分型[J]. 化学研究与应用, 2012, 0(10): 1465-1471 |
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| 作者姓名： | 郭莉萍 汪雪娇 豆兴茹 邱婷 谢洪平 |
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| 作者单位： | 苏州大学医学部药学院;重庆科技学院化学化工学院 |
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| 摘 要： | 本文基于近红外光谱结合化学模式识别中的偶合人工神经网络(ANN-ANN)法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法。选择STR基因座D5S818的差异较小的10-11、11-11、11-12与11-13基因型作为研究对象,将这四个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR产物的近红外光谱,以近红外光谱为判别变量,以其中一个ANN(rich-information-extracted ANN,RIE-ANN)用于提取建立判别模型的富信息变量,另一个ANN(discriminant-model-built ANN,DMB-ANN)即用于模型建立。ANN-ANN的网络结构为:338-30-338(RIE-ANN)和30-8-4(DMB-ANN)。对于校正集的校正均方根误差为0.0148,预测集为0.0127,预测准确率达到100%。成功实现了基于近红外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测。
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| 关 键 词： | 短串联重复序列 近红外光谱 人工神经网络 基因分型 |
Genotyping of D5S818 locus based on near infrared spectroscopy and two combined artificial neural networks |
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| GUO Li-ping,WANG Xue-jiao,DOU Xing-ru,QIU Ting,XIE Hong-ping. Genotyping of D5S818 locus based on near infrared spectroscopy and two combined artificial neural networks[J]. Chemical Research and Application, 2012, 0(10): 1465-1471 |
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| Authors: | GUO Li-ping WANG Xue-jiao DOU Xing-ru QIU Ting XIE Hong-ping |
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| Affiliation: | 1(1.College of Pharmaceutical Sciences,Medical School,Soochow University,Suzhou 215123,China; 2.College of Chemistry and Chemical Engineering,Chonqing University of Science and Technology,Chongqing 401331,China) |
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| Abstract: | |
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