基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA2抑制剂 |
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作者姓名: | 钟立鹏 姚敏 乐贞 黄春洪 |
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作者单位: | 南昌大学基础医学院,江西 南昌,330006 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,江西省科技支撑计划 |
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摘 要: | 天然的分泌型磷脂酶A2(Secretory phospholipase A2,sPLA2)抑制蛋白主要是蛇磷脂酶A2抑制蛋白γ(Snake phospholipase A2inhibitor proteinγ,PLIγ)。通过分析华游蛇PLIγ序列的结构特点及活性区,设计短肽PLA2抑制剂。运用Autodock分子对接软件,分析短肽与sPLA2的相互作用,通过pH动态监测法验证其抑制活性。设计得到的CPGV肽可以与sPLA2的疏水性活性中心结合,该四肽对蛇毒sPLA2的活性抑制率为69.12%。通过生物信息学和分子对接模拟筛选,成功地设计了PLIγ的活性肽。
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关 键 词: | 蛇磷脂酶A2抑制蛋白 分泌型磷脂酶A2 生物信息学 分子对接 |
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