基于多光谱方法和计算模拟的细胞色素CYP1A2与阿奇霉素的结合机制研究 |
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引用本文: | 史梦洁,林晓莲,黄芝辉,徐敏华,何进锋,刘红艳.基于多光谱方法和计算模拟的细胞色素CYP1A2与阿奇霉素的结合机制研究[J].化学研究与应用,2024(2):245-253. |
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作者姓名: | 史梦洁 林晓莲 黄芝辉 徐敏华 何进锋 刘红艳 |
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作者单位: | 桂林理工大学化学与生物工程学院,广西电磁化学功能物质重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(2216060011)资助; |
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摘 要: | 为了解阿奇霉素(AZI)在模拟的人体环境中与CYP1A2的结合情况,探索AZI在人体内的转化机制,本论文使用分子对接、分子动力学模拟、荧光光谱、紫外分光光度法、傅立叶变换红外光谱、圆二色光谱等多种实验方法,阐明AZI与CYP1A2之间的相互作用机制。分子对接结果表明AZI与CYP1A2的结合方式是半包裹并且以疏水作用力相结合。分子动力学模拟结果表明,CYP1A2-AZI复合物的均方根偏差(RMSD)值增大;均方根波动(RMSF)值表明复合物体系柔性较大;回旋半径(Rg)值表明蛋白质特定区域的结构松散。荧光猝灭光谱实验表明,CYP1A2与AZI是以静态猝灭机制结合在一起。热力学参数表明AZI与CYP1A2之间的主导作用力为疏水作用力。时间分辨光谱表明AZI对CYP1A2的机制为静态猝灭。紫外光谱实验表明AZI与CYP1A2反应生成了复合物。红外光谱实验结果表明CYP1A2的二级结构含量发生了改变。圆二色光谱证实AZI对CYP1A2的二级结构产生影响。
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关 键 词: | 阿奇霉素 CYP1A2 相互作用 分子计算模拟 多光谱表征 |
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