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盐离子对B-DNA到Z-DNA结构转变影响的理论研究
引用本文:董瑞新,闫循领. 盐离子对B-DNA到Z-DNA结构转变影响的理论研究[J]. 物理学报, 2004, 53(12): 4414-4419
作者姓名:董瑞新  闫循领
作者单位:(1)聊城大学物理科学与信息工程学院,聊城 252059; (2)聊城大学物理科学与信息工程学院,聊城 252059电子科技大学物理电子学院,成都 610054
基金项目:国家自然科学基金 (批准号: 60471049)资助的课题.
摘    要:在已给出的与溶液盐浓度有关的DNA弹性模型基础上, 考虑到Z-DNA的碱基堆积和氢键相互 作用, 给出了一个新的B-DNA到Z-DNA的结构转变模型. 研究了盐浓度对B—Z结构转变特性的影响, 得到了力延伸曲线、折叠角概率分布以及B—Z结构转变的临界扭矩随盐浓度的变化规律.结果表明: 当盐浓度达到2.4mol/L时, 松弛DNA的Z构象开始出现, 并且随盐浓度的增加, Z构象存在的概率增大, B—Z转变所需的扭转力矩减小. 关键词:DNA弹性盐浓度B—Z结构转变堆积能

关 键 词:DNA弹性  盐浓度  B—Z结构转变  堆积能
收稿时间:2004-04-21

The theoretical study of the effects of salt on structure transition of B-DNA to Z-DNA
DONG Rui-xin,YAN Xun-ling. The theoretical study of the effects of salt on structure transition of B-DNA to Z-DNA[J]. Acta Physica Sinica, 2004, 53(12): 4414-4419
Authors:DONG Rui-xin  YAN Xun-ling
Abstract:On the basis of our previous elastic model which is related to the salt ion conc entration, we put forth a new model of B-DNA to Z-DNA transition by considerin g interactions of the hydrogen-bond and base-stacking in Z-DNA, and discuss the effects of salt concentration on the structure transition of B-Z and obtain the force extension curves, the probability distribution curve of the folding angle and the critical torque of B-Z transition at various salt concentrations. The results show that Z-DNA appears when salt concentration reaches 2.4mol/L,and the probability of Z-form begins to increase and the torsion of B-Z trans ition decreases with the increase of salt concentration.
Keywords:elasticity of DNA   salt concentration   B to Z transition   stacking energy
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