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| 基于丙氨酸扫描与相互作用熵方法的PARP1与配体的结合自由能计算 | |
| 引用本文： | 张右梓,刘笑,周一凡,张增辉.基于丙氨酸扫描与相互作用熵方法的PARP1与配体的结合自由能计算[J].中国科学:化学,2018(2). |
| 作者姓名： | 张右梓 刘笑 周一凡 张增辉 |
| 作者单位： | 精密光谱科学与技术国家重点实验室华东师范大学化学与分子工程学院;NYU-ECNU计算化学联合研究中心;上海纽约大学; |
| 摘 要： | PARP1蛋白是真核细胞DNA损伤修复的关键因子,也是近年来肿瘤治疗的新热靶标之一.本文运用本课题组发展的基于相互作用熵方法并结合MM/GBSA方法对蛋白-配体进行丙氨酸扫描,计算了10个抑制剂小分子与PARP1蛋白及与PARP1蛋白各残基间的相互作用结合自由能并由此获得总的结合自由能.计算结果表明,相比传统MM/GBSA方法,新的计算方法可以显著提高蛋白-配体结合自由能计算的精度,缩小与实验值的误差. |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |