| PAMAM树枝形分子与KALP肽相互作用的计算机模拟研究 |
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| 引用本文： | 陈素玲,潘明强,田文得.PAMAM树枝形分子与KALP肽相互作用的计算机模拟研究[J].高分子学报,2014(8). |
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| 作者姓名： | 陈素玲 潘明强 田文得 |
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| 作者单位： | 软凝聚态物理及交叉研究中心&物理与光电·能源学部;苏州大学机电学院;苏州纳米科技协同创新中心苏州大学; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(基金号21104056,91027040,61106110);国家重点基础研究发展计划(973计划,项目号2012CB821500)资助项目 |
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| 摘 要： | 采用粗粒化的分子动力学模拟研究了跨膜多肽,lysine-flanked peptide(KALP),对第四代聚酰胺-胺(PAMAM)树枝形分子形态结构的影响.考虑了中性和酸性两种不同pH环境下两个分子间的相互作用行为.计算了PAMAM分子的回转半径、非球形因子、相对于树枝形分子质心的径向密度分布函数,和两分子间的平均力势.模拟发现在两种pH环境下KALP多肽对树枝形分子的大小、形状及密度分布影响不大,证实了PAMAM树枝形分子内部有一定空间容纳KALP多肽分子.自由能的计算结果表明酸性pH环境中PAMAM分子排斥KALP肽,无法形成复合结构;在中性pH环境中,两种分子也不容易形成稳定的复合结构.
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| 关 键 词： | 树枝形分子 多肽 分子动力学 平均力势 |
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