| 基于药物数据报道数据库的虚拟组合片段库构建 |
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| 引用本文： | 张珉,盛春泉,徐辉,宋云龙,张万年.基于药物数据报道数据库的虚拟组合片段库构建[J].中国科学B辑,2007,37(3):288-294. |
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| 作者姓名： | 张珉 盛春泉 徐辉 宋云龙 张万年 |
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| 作者单位： | 第二军医大学药学院,上海,200433 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划);国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 对药物数据报道数据库中142553个药物分子进行统计分析, 提取得到了这些药物分子的共同结构特征. 根据药物分子的结构特征将其拆分为环结构、侧链和连接子, 共整理得到32017个片段结构, 其中环结构13642个、侧链10076个、连接子8299个. 为更好地指导全新药物设计, 利用拆分片段构建了三个虚拟组合片段数据库: 用环结构和侧链组合方式构建了药效基团库, 含有34244个片段; 用环结构的刚性特点构建了基本骨架库, 含有片段13574个; 直接利用连接子构建了连接片段库, 含有连接片段8051个. 库中所有片段都经过能量优化, 均具有合理的构型和构象, 可以用于虚拟组合库的构建和全新药物设计.
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| 关 键 词： | 片段 分子数据库 统计分析 药物分子 药物设计 |
| 收稿时间： | 2006-01-20 |
| 修稿时间： | 2006年1月20日 |
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