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金丝桃素分子结构及其与HIV病毒蛋白酶作用的分子动力学研究
引用本文:曲晓波,苏忠民,胡冬华,鲍永利,孟祥颖,乌垠,李玉新.金丝桃素分子结构及其与HIV病毒蛋白酶作用的分子动力学研究[J].高等学校化学学报,2009,30(7):1402-1405.
作者姓名:曲晓波  苏忠民  胡冬华  鲍永利  孟祥颖  乌垠  李玉新
作者单位:1. 东北师范大学细胞与遗传学研究所,长春,130024;长春中医药大学新药研发中心,长春,130117
2. 东北师范大学化学学院功能材料化学研究所,长春,130024
3. 东北师范大学化学学院功能材料化学研究所,长春,130024;长春中医药大学新药研发中心,长春,130117
4. 东北师范大学细胞与遗传学研究所,长春,130024
基金项目:国家自然科学基金,吉林省科技厅科技攻关项目,吉林省科技发展计划重点项目 
摘    要:采用用计算化学方法研究金丝桃素分子结构特征, 并用分子动力学方法研究其与HIV蛋白酶的相互作用, 探讨其可能的抗HIV病毒作用机理. 结果表明, 金丝桃素分子结构具有刚性特征, 与HIV蛋白酶在酶的催化活性位点与ASP-A25 and ASP-B25以氢键作用相结合.

关 键 词:金丝桃素  HIV蛋白酶  分子动力学模拟  分子对接
收稿时间:2008-04-23

Studies on Molecular Structure of Hypericin and Its Interactions with HIV-1 Protease by Molecular Modeling
QU Xiao-Bo,SU Zhong-Min,HU Dong-Hua,BAO Yong-Li,MENG Xiang-Ying,WU Yin,LI Yu-Xin.Studies on Molecular Structure of Hypericin and Its Interactions with HIV-1 Protease by Molecular Modeling[J].Chemical Research In Chinese Universities,2009,30(7):1402-1405.
Authors:QU Xiao-Bo  SU Zhong-Min  HU Dong-Hua  BAO Yong-Li  MENG Xiang-Ying  WU Yin  LI Yu-Xin
Institution:1. Institute of Genetics and Cytology;Northeast Normal University;Changchun 130024;China;2. Institute of Functional Material Chemistry;Faculty of Chemistry;3. Centre of Research and Development of New Drug;Changchun University of Traditional Chinese Medicine;Changchun 130117;China
Abstract:Hypericin is a virucidal agent with activity against cancer and a broad range of viruses. However, its pharmacology and mechanism of action are still unclear. This investigation focus on the possible inhibits activity of hypericin on HIV-1 protease(HIV-IP) function and related pathways. Results indicate that hypericin is rigidly held in the catalyst active site of HIV-1P close to the catalyst residues of ASP-A25 and ASP-B25 with hydrogen bond interaction. These results may provide insights for study on anti...
Keywords:Hypericin  HIV-1 Protease  Molecular dynamics simulation  Molecular docking  
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