H3K79me3在结直肠癌EMT-MET过程中的作用 |
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引用本文: | 翟媛媛,李前忠,陈颖丽.H3K79me3在结直肠癌EMT-MET过程中的作用[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2022(2):150-157. |
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作者姓名: | 翟媛媛 李前忠 陈颖丽 |
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作者单位: | 内蒙古大学物理科学与技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32160216,61861035); |
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摘 要: | 上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)及其逆过程间充质-上皮转化(mesenchymal-epithelial transition, MET)是肿瘤转移的关键过程。以结直肠癌(colorectal cancer, CRC)转移期间在EMT和MET之间表达改变相反的基因为研究对象(即在EMT中下调然后在MET中上调的基因(ED-MU)和在EMT中上调然后在MET中下调的基因(EU-MD)),计算并比较了EMT-MET过程中组蛋白修饰水平和基因表达水平的变化,结果发现ED-MU基因启动子中的H3K79me3水平在EMT过程降低然后在MET过程升高。基于组蛋白修饰特征,使用随机森林对与EMT-MET相关的上下调基因进行了预测,结果发现H3K79me3的预测结果最好(AUC=0.974)。通过构建蛋白质相互作用网络确定了10个与转移相关的hub基因。最后,计算了hub基因启动子区组蛋白修饰水平的变化,结果...
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关 键 词: | H3K79me3 EMT MET 结直肠癌 hub基因 |
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