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基于酮醇酸还原异构酶KARI复合物晶体结构的三维数据库搜寻
引用本文:王宝雷,李正名,马翼,王建国,罗小民,左之利.基于酮醇酸还原异构酶KARI复合物晶体结构的三维数据库搜寻[J].有机化学,2004,24(8):973-976.
作者姓名:王宝雷  李正名  马翼  王建国  罗小民  左之利
作者单位:1. 南开大学元素有机化学研究所,元素有机化学国家重点实验室,天津,300071
2. 中国科学院上海药物研究所,上海,200031
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划),天津市科委科研项目,天津大学校科研和教改项目
摘    要:以酮醇酸还原异构酶KARI复合物0.16nm5高分辨率晶体结构为基础,采用DOCK 4.O分子对接程序通过MDDL/ACD三维数据库搜寻,找到了279个与KARI结合能较低的小分子,讨论了能量打分较高分子同靶酶的作用模式.这些分子作为潜在的KARI抑制剂为基于KARI的农药分子设计提供了有利指导.

关 键 词:分子对接  三维数据库
修稿时间:2003年7月17日

3D-Database Searching Based on the Crystal Structure of Ketol-acid Reductoisomerase (KARI) Complex
Abstract:Based on the reported crystal structure of complexes of the enzyme ketol-acid reductoisomerase (KARI), 279 molecules were obtained with predicted high affinity for KARI from MDL/ACD 3D-database searching, using program DOCK 4.0. The interaction pattern between some top-ranked molecules and KARI was described. These structures provide information for further design of new potential herbicidal molecules targeted at KARI.
Keywords:KARI
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