环孢霉素A分子的随机动力学模拟

环孢霉素A是一种免疫抑制剂,其分子动力学和随机动力学模拟表明极性溶剂的平均势对构象和动力学影响不可忽略。本文提出一种近似方法来处理这一效应,即溶剂的平均影响采用振子势来表示,其中力常数假设正比于溶剂的可接近表面积权重因子。将这一方法应用到对环孢霉素A的平衡构象和动力学模拟,结果表明,在平均结构、氢键形成比率、主链构象和侧链二面角几个方面,本方法较未加平均场的随机动力学有较大改进。