四川省结核分枝杆菌基因分型中MIRU-VNTR位点稳定性评价 |
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引用本文: | 罗槑.四川省结核分枝杆菌基因分型中MIRU-VNTR位点稳定性评价[J].四川大学学报(自然科学版),2015,52(5). |
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作者姓名: | 罗槑 |
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摘 要: | 摘要: 本文收集四川省2009-2013年184株结核分枝杆菌菌株,用标准12 MIRU-VNTR位点组对四川省结核分枝杆菌菌株进行基因分型研究,评估四川地区一线VNTR分型位点的稳定性,确定四川地区保守位点组合及主要MIT型。184株结核分枝杆菌基因分型后得到51个基因型,12个基因型成簇。本研究确定当前四川地区12高分辨力位点VNTR分型方法中的7个MIRU位点依然具有较高的分辩能力(h > 0.55)。MIRU02, MIRU20, MIRU23, MIRU24为多态性最低的4个位点(0 ≤ h < 0.4),保守位点组的主要MIT型为“2251”。四川省结核分枝杆菌VNTR位点的多态性保持稳定,目前采用的12高分辨力VNTR位点依然稳定可靠,本研究首次确定了四川地区保守位点组及主要MIT型,为下一步结核分枝杆菌进化研究奠定了基础。
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关 键 词: | 结核分枝杆菌 数目可变串联重复序列多态性 可变数目串联重复国际类型 四川地区 |
收稿时间: | 2015/1/28 0:00:00 |
修稿时间: | 2015/5/5 0:00:00 |
Evaluation of the stability and conservation of MIRU-VNTR loci of Mycobacterium tuberculosis in Sichuan |
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Abstract: | |
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Keywords: | Mycobacterium tuberculosis MIRU-VNTR MIT Sichuan |
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