关于副本交换分子动力学模拟复杂化学反应的研究(英文) |
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引用本文: | 辛亮,孙淮.关于副本交换分子动力学模拟复杂化学反应的研究(英文)[J].物理化学学报,2018(10). |
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作者姓名: | 辛亮 孙淮 |
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作者单位: | 上海交通大学化学化工学院;吉林大学无机合成与制备化学国家重点实验室;上海交通大学材料基因组联合研究中心 |
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摘 要: | 本文研究用温度副本交换分子动力学(T-REMD)和哈密顿副本交换分子动力学(H-REMD)方法模拟复杂化学反应的问题。使用具有不同活化能和反应能的简单置换反应模型,我们检验了上述两种方法用来预测反应平衡产物的效率和应用范围。T-REMD方法对具有适度活化能(约20 kcal·mol~(-1))或者反应能量(3 kcal·mol~(-1))的放热反应是有效的。由于在相空间的不完整采样,对于同时具有高活化能和反应能量的反应其模拟效率有严重障碍,并且对于吸热反应问题更为显着。另一方面,H-REMD对一系列具有不同活化能的反应能的模型表现出色,与T-REMD相比,H-REMD可以使用更少的副本获得优异的结果。
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