| 卵形鲳鲹神经坏死病毒基因组的分析及其特异性检测引物的筛选 |
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| 引用本文： | 王君芳,杜和禾,汤诗琪,周永灿,曹贞洁,孙云.卵形鲳鲹神经坏死病毒基因组的分析及其特异性检测引物的筛选[J].海南大学学报(自然科学版),2022(3):251-259. |
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| 作者姓名： | 王君芳 杜和禾 汤诗琪 周永灿 曹贞洁 孙云 |
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| 作者单位： | 海南大学海南省南海海洋资源利用国家重点实验室海南省热带水生生物技术重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项（2020YFD0901100-3）； |
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| 摘 要： | 从海南发病的卵形鲳鲹中分离到一株病毒，经测序分析，推测该病毒为神经坏死病毒.提取病鱼脑部、眼部总RNA，并用其反转的cDNA为模板，分段克隆出RNA1和RNA2片段，测序后通过拼接获得其基因组，命名为GPNNV(Golden Pompano Nervous Necrosis Virus).系统进化树分析结果表明，GPNNV属于RGNNV基因型.为了获得GPNNV特异性强、灵敏度高的检测引物，本研究基于GPNNV的RNA2保守区设计了9对检测引物，然后通过普通PCR及实时荧光定量PCR技术，筛选出1对最佳引物，可以检测到病毒含量为10copies·μL-1的样本.采用筛选出的引物，在病鱼组织中进行检测，结果表明该引物可以准确检测出感染病毒性神经坏死病毒的样本，具有较高的实际应用价值.以上结果可为卵形鲳鲹神经坏死病毒病的诊断提供有效的方法，对卵形鲳鲹神经坏死病毒病的预防具有重要意义.
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| 关 键 词： | 神经坏死病毒 基因组测序 引物筛选 实时定量聚合酶链式反应 |
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