天然产物针对Caspase-1的虚拟筛选研究 |
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引用本文: | 杨若琪,程斌,闫滨.天然产物针对Caspase-1的虚拟筛选研究[J].化学研究与应用,2022(11):2661-2670. |
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作者姓名: | 杨若琪 程斌 闫滨 |
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作者单位: | 1. 山东中医药大学药学院;2. 山东中医药大学附属医院 |
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摘 要: | 为了寻找靶向Caspase-1的活性化合物,本研究建立了四种机器学习分类模型(RF、SVM、ANN和VOTING)。这些模型根据不同的评估指标进行了比较,具有高曲线下面积(AUC)的最佳分类模型被用来对ZINC数据库中的天然产物进行虚拟筛选。随后通过不同的药物相似性规则对化合物的ADMET特性进行了过滤。此外,考虑到蛋白质与配体结合的实际情况,本文对每个选定的配体与Caspase-1进行了分子对接和相互作用分析。根据计算出的结合能进行排序,并筛选出3个潜在的抑制剂。
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关 键 词: | Caspase-1 天然产物 虚拟筛选 机器学习 分子对接 |
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