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天然产物针对Caspase-1的虚拟筛选研究
引用本文:杨若琪,程斌,闫滨.天然产物针对Caspase-1的虚拟筛选研究[J].化学研究与应用,2022(11):2661-2670.
作者姓名:杨若琪  程斌  闫滨
作者单位:1. 山东中医药大学药学院;2. 山东中医药大学附属医院
摘    要:为了寻找靶向Caspase-1的活性化合物,本研究建立了四种机器学习分类模型(RF、SVM、ANN和VOTING)。这些模型根据不同的评估指标进行了比较,具有高曲线下面积(AUC)的最佳分类模型被用来对ZINC数据库中的天然产物进行虚拟筛选。随后通过不同的药物相似性规则对化合物的ADMET特性进行了过滤。此外,考虑到蛋白质与配体结合的实际情况,本文对每个选定的配体与Caspase-1进行了分子对接和相互作用分析。根据计算出的结合能进行排序,并筛选出3个潜在的抑制剂。

关 键 词:Caspase-1  天然产物  虚拟筛选  机器学习  分子对接
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