基于序列结构的miRNAs的聚类分析

microRNAs(miRNAs)是一类高度保守的序列片段,能调控生物体的生长发育。至今对它的聚类研究,还处在基于传统遗传模型的分析阶段。本文根据miRNAs本身的结构特点,提出了一种基于序列结构的聚类分析算法。该算法通过借鉴组合数学中随机排列及稀疏矩阵的思想,利用序列的各个组成成分的相似性来表征miRNAs序列间的距离。本算法不仅大大减少了人为因素的影响,还有效的反映成熟miRNAs间在结构上的关联性,为进一步研究miRNAs的功能提供了便利。