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| 抑制剂BD2对PKA与PKCβⅡ的抑制选择性研究 | |
| 引用本文： | 金海晓,吴天星,严小军,蒋勇军,邹建卫.抑制剂BD2对PKA与PKCβⅡ的抑制选择性研究[J].化学学报,2009,67(13). |
| 作者姓名： | 金海晓 吴天星 严小军 蒋勇军 邹建卫 |
| 作者单位： | 1. 宁波大学海洋生物工程重点实验室,宁波,315211 2. 浙江大学化学系,杭州,310027 3. 浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室,宁波,315100 |
| 基金项目： | 教育部长江学者和创新团队发展计划，宁波大学王宽诚幸福基金 |
| 摘 要： | 蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)的过度表达导致细胞生长分化异常,是治疗肿瘤的潜在靶点.抑制剂BD2对PKA和PKC抑制作用存在高选择性.为了探讨BD2高选择性机制,本工作以PKA与BD2复合物的晶体结构为模板,通过同源模建结合分子对接的方法构建PKC βⅡ与BD2复合物的结构,并对PKA-BD2复合物和PKC-BD2复合物进行了2.5 ns的分子动力学模拟,运用MM-GBSA方法计算了结合自由能,通过能量分解的方法考察PKA和PKC的主要残基与BD2之间的相互作用和识别机制.结合能分析结果很好地描述了BD2对PKA抑制活性比其对PKC抑制活性高这一实验现象.氢键分析和能量分解结果共同说明了BD2的B环和酰胺链部分与PKA和PKC中相应位点的残基之间的相互作用存在差异,这是BD2存在选择性的内在因素.BD2高选择性作用机制的阐明为进一步基于结构的balanol类抑制剂的结构设计和优化提供了合理的指导. |
| 关 键 词： | 蛋白激酶A(PKA) 蛋白激酶C(PKC) 同源模建 分子对接 分子动力学模拟 抑制选择性 |
Study on Selectivity of Inhibitor BD2 for PKA over PKC βⅡ |
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| Jin,Haixiao,Wu,Tianxing,Yan,Xiaojun,Jiang,Yongjun,Zou,Jianwei.Study on Selectivity of Inhibitor BD2 for PKA over PKC βⅡ[J].Acta Chimica Sinica,2009,67(13). | |
| Authors: | Jin Haixiao Wu Tianxing Yan Xiaojun Jiang Yongjun Zou Jianwei |
| Institution: | a Key Laboratory of Marine Biotechnology;Ningbo University;Ningbo 315211;b Department of Chemistry;Zhejiang University;Hangzhou 310027;c Key Laboratory for Molecular Design and Nutrition Engineering;Ningbo Institute of Technology;Ningbo 315100 |
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| Keywords: | |
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