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基于单细胞质谱分析的膀胱癌细胞分型研究
引用本文:孙佳琪,陈安琪,闫明月,傅广候,李刚强,金百冶,陈腊,闻路红.基于单细胞质谱分析的膀胱癌细胞分型研究[J].分析测试学报,2023(5):621-627.
作者姓名:孙佳琪  陈安琪  闫明月  傅广候  李刚强  金百冶  陈腊  闻路红
作者单位:1. 宁波大学 高等技术研究院,浙江 宁波 315211; 2. 宁波华仪宁创智能科技有限公司,浙江 宁波 315100; 3. 广州市华粤行仪器有限公司,广东 广州 511400; 4. 浙江大学医学院附属第一医院,浙江 杭州 310009
基金项目:国家重点研发计划资助项目(2022YFF0705002);国家自然科学基金资助项目(81902604);浙江省重点研发计划项目(2020C03026,2020C02023);宁波市3315创新团队项目(2017A-17-C);宁波市重点研发计划项目(2022Z130);广州市番禺区创新创业领军团队资助项目(2017-R01-5);宁波大学王宽诚幸福基金项目
摘    要:单细胞质谱分析能够获得单个细胞的代谢图谱,揭示细胞之间的异质性,在肿瘤学研究中具有重要价值。该文采用单细胞质谱和机器学习技术,建立了膀胱癌细胞亚型的鉴别方法。基于所采集的单细胞代谢数据,分别使用线性判别分析、随机森林、支持向量机、逻辑回归建立了机器学习分类模型,并进行了模型的性能评估。结果表明,各机器学习模型均具有良好的膀胱癌细胞分型能力,分类准确率≥94.9%,灵敏度≥88.6%,特异度≥93.3%。其中,随机森林算法的分类准确率达100%,模型的受试者工作特征曲线下面积达1。该方法实现了膀胱癌单细胞的代谢物检测及细胞亚型区分,也为更广泛的单细胞代谢组学研究提供了参考。

关 键 词:单细胞质谱分析  膀胱癌  代谢物检测  细胞分型

Typing of Bladder Cancer Cells Based on Single-cell Mass Spectrometry
SUN Jia-qi,CHEN An-qi,YAN Ming-yue,FU Guang-hou,LI Gang-qiang,JIN Bai-ye,CHEN L,WEN Lu-hong.Typing of Bladder Cancer Cells Based on Single-cell Mass Spectrometry[J].Journal of Instrumental Analysis,2023(5):621-627.
Authors:SUN Jia-qi  CHEN An-qi  YAN Ming-yue  FU Guang-hou  LI Gang-qiang  JIN Bai-ye  CHEN L  WEN Lu-hong
Abstract:
Keywords:single-cell mass spectrometry  bladder cancer  metabolite detection  cell typing
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