化学环境编码与分子相似度计算

分子相似度方法主要用于药物分子设计中先导化合物的选取及化合物物理、化学性质的预测，这种方法所依据的原理是：相似的化合物结构将具有相似的化学及物理性质［‘，’1．将已知具有某种性质的化合物的结构（常称为探针化合物）与诸多化合物进行比较，由此得到与之相似的化合物，这种邻近化合物有可能在分子设计中做先导化合物．近年来已报道过多种化合物相似度的计算方法，可粗略的归为以下几类：（l）结构碎片法［‘’‘j；（2）拓扑指数法卜·“；（3）量子化学方法［’，’j．本文提出一种新的化学环境编码方法，该方法有别于结构碎片…

Code for Chemical Environment and Computation of Molecular Similarity

A new code for chemical environment and an empirical mathematical pattern Sam on computation of molecular similarity were suggested. Seven molecules which referred to as the probe compounds and the nearest neighbors of each probe structure were determined by the methods of Sa. and Tanimoto. The results show an intuitive notion of chemical similari-ty.