| Aerolysin纳米孔核酸检测灵敏区域的协同相互作用探索研究 |
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| 引用本文： | 李孟寅,应佚伦,龙亿涛.Aerolysin纳米孔核酸检测灵敏区域的协同相互作用探索研究[J].化学学报,2019,77(10):984-988. |
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| 作者姓名： | 李孟寅 应佚伦 龙亿涛 |
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| 作者单位： | 华东理工大学化学与分子工程学院 上海200237;华东理工大学化学与分子工程学院 上海200237;南京大学化学化工学院生命分析国家重点实验室 南京210023 |
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| 基金项目： | 项目受国家自然科学基金21834001(21834001);项目受国家自然科学基金61871183(61871183) |
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| 摘 要： | 纳米孔单分子检测技术以其简便、快速、高通量及无需标记等特点, 应用于DNA及蛋白质测序, 更有望实现单分子动态构象变化的研究. Aerolysin(气单胞菌溶素)纳米孔道由于其特有的较长的β-桶限域区(β-barrel)及孔内壁丰富的带电荷氨基酸残基, 在单个寡聚核苷酸分子分析中展现出极高的灵敏性. 本设计利用dA14-4-X, dA14-11-X, dA14-4-X-11-X (X=C, T, G)等单个寡聚核苷酸探针分子, 研究了Aerolysin的两个灵敏区域R1和R2, 探索了R1灵敏区域对单个碱基弱相互作用的差异, 实现区分单个碱基差异. 进一步实验证明, R1灵敏区域对单个碱基类型差异的灵敏区分不受R2灵敏区域被碱基A、C、T占位所影响. 然而, 当R2区域被碱基G占位时, 会使R1区域丧失对整个孔道电流的主导性. 本研究有助于理解Aerolysin对单个寡聚核苷酸分子的超灵敏测量机制.
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| 关 键 词： | 纳米孔 单分子界面 电化学限域 气单胞菌溶素 寡聚核苷酸 |
Unveiling the Synergistic Effect from Key Sensing Regions in Aerolysin-Based Single Oligonucleotide Detection |
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| Li,Mengyin,Ying,Yilun,Long,Yi-Tao.Unveiling the Synergistic Effect from Key Sensing Regions in Aerolysin-Based Single Oligonucleotide Detection[J].Acta Chimica Sinica,2019,77(10):984-988. |
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| Authors: | Li Mengyin Ying Yilun Long Yi-Tao |
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| Institution: | a School of Chemistry and Molecular Engineering, East China University of Science and Technology, Shanghai 200237b State Key Laboratory of Analytical Chemistry for Life Science, School of Chemistry and Chemical Engineering, Nanjing University, Nanjing 210023 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | nanopore single-molecule interface electro confinement aerolysin oligonucleotide |
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