蛋白酶体对抗原蛋白酶切特异性的研究 |
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引用本文: | 宋哲,刘涛,焦春波,刘伟,朱鸣华,王晓刚.蛋白酶体对抗原蛋白酶切特异性的研究[J].中国科学B辑,2008,38(9):808-815. |
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作者姓名: | 宋哲 刘涛 焦春波 刘伟 朱鸣华 王晓刚 |
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作者单位: | ① 大连理工大学高科技研究院, 大连 116023;
② 大连理工大学物理与光电工程学院, 大连 116023 |
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摘 要: | 在MHCI类分子结合的抗原表位加工呈递途径中,泛素-蛋白酶体系统对抗原蛋白的降解发挥着重要作用。为了进一步研究蛋白酶体的酶切特异性,采用偏最小二乘方法(partial least squares method,PLS)建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型,预测准确度为82.8%;由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,它反映了蛋白酶体对抗原蛋白酶切的相互作用信息,也表明蛋白酶体对抗原蛋白酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的。
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关 键 词: | 蛋白酶体 抗原表位 偏最小二乘法 |
收稿时间: | 2008-03-11 |
修稿时间: | 2008-05-30 |
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