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EPR和NMR自旋标记法研究部分折叠蛋白质构象
引用本文:朱磊,刘志军. EPR和NMR自旋标记法研究部分折叠蛋白质构象[J]. 波谱学杂志, 2011, 28(4): 523-533
作者姓名:朱磊  刘志军
作者单位:中国科学院 强磁场科学中心,安徽 合肥 230031
基金项目:中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目专项经费(Y06HCG1121B2Q); 国家自然科学基金青年基金资助项目(31100539)
摘    要:部分折叠蛋白质的特征是在溶液中有部分二级结构,但是三级结构接触比较松散或者较少,其意义可能是蛋白质折叠过程的中间态,或者有重要的生理功能. 利用EPR和NMR波谱可以表征其构象特征,从而构建其二级结构、三级结构、四级结构以及构象变化的结构模型. 利用分子生物学的点突变技术可以在蛋白质主链上插入1个或2个半胱氨酸残基,然后把顺磁自旋标记物特异地共价结合在半胱氨酸的侧链巯基上来制备自旋标记样品. 位点特异性自旋标记电子顺磁共振(SDSL-EPR)波谱是通过测定2个自旋标记间的偶极相互作用,从而推测2个硝基氧自由基间的距离. 核磁共振(NMR)波谱则是通过测定单个自旋标记中心对周围原子核驰豫效应增强(PRE)的效应,推测出顺磁中心相对于周围原子核的距离. 连续波EPR和NMR自旋标记方法可以测定2.5 nm左右的偶极相互作用距离,属于长程的距离约束,这对于确定部分折叠蛋白质的构象至关重要. 该文将就蛋白质部分折叠态研究的生物学意义,自旋标记方法以及EPR和NMR方法研究其构象特征举例描述.

关 键 词:电子顺磁共振(EPR)   核磁共振(NMR)   部分折叠蛋白质   构象   距离约束  
收稿时间:2011-09-30

Conformational Studies of Partially Folded Protein by EPR and NMR Spin Labeling Methods: A Review
ZHU Lei,LIU Zhi-jun. Conformational Studies of Partially Folded Protein by EPR and NMR Spin Labeling Methods: A Review[J]. Chinese Journal of Magnetic Resonance, 2011, 28(4): 523-533
Authors:ZHU Lei  LIU Zhi-jun
Affiliation:High Magnetic Field Laboratory, Chinese Academy of Sciences, Hefei 230031, China
Abstract:Partially folded proteins,characterized as exhibiting secondary structure elements with loose or absent tertiary contacts,are important intermediates in physiological protein folding and under pathological conditions.Structural restraints derived from EPR and NMR spectroscopy can be used to test and build secondary,tertiary,and quaternary structural models as well as measure protein conformational changes in solution.Insertion of one or two cysteine residues into the protein backbone using molecular biology...
Keywords:EPR  NMR  partially folded protein  conformation  distance restraints  
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