| 结合QSAR、分子对接和动力学模拟剖析小分子与不同受体的结合亲和力 |
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| 引用本文： | 伍智蔚,易忠胜,董露,冯理涛.结合QSAR、分子对接和动力学模拟剖析小分子与不同受体的结合亲和力[J].分析科学学报,2016(3):320-324. |
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| 作者姓名： | 伍智蔚 易忠胜 董露 冯理涛 |
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| 作者单位： | 广西高校食品安全与检测重点实验室,岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心,桂林理工大学化学与生物工程学院,广西桂林541004 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(No.21267008;21167006)，广西自然科学基金(No.2013GXNSFAA019034)，广西高等学校高水平创新团队及卓越学者计划项目(桂教人[2014]49号) |
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| 摘 要： | 本文从三种不同的角度分析小分子与受体的结合情况,互相补充,为探讨不同类型结合模式提供有用的信息和研究手段。利用比较分子相似性指数法(CoMSIA)和分子全息定量构效关系法(HQSAR),建立一系列小分子与不同受体(AhR和TTR)亲和力活性数据的定量构效关系预测模型。结果表明模型均具有较高稳定性和预测能力(q~20.55,r~20.85)。同时,根据CoMSIA模型的等值线图和HQSAR模型的原子贡献图得出BDE154和BDE019与受体之间的结合作用方式,主要为疏水作用,带羟基基团化合物不利于与受体结合。此外,分子对接结果表明模型的结合力类型分别为疏水作用和π-π堆积作用。而分子动力学模拟的结果表明,随着小分子的加入,受体的二级结构发生转变。
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| 关 键 词： | 多溴二苯醚 分子对接 定量构效关系法 分子动力学模拟 亲和力 |
Analyzing the Affinity of Small Molecules with Different Receptors with QSAR,Molecular Docking and Molecular Dynamic Simulation |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PBDEs Molecular Docking QSAR Molecular Dynamic Simulation affinity |
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