水环境对GC和AT碱基对质子转移的影响 |
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作者姓名: | 吴颖曦 王红艳 林月霞 |
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作者单位: | 西南交通大学物理科学与技术学院; |
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基金项目: | 国家自然科学基金(10974161,11174237);国家重点基础研究发展规划项目(973)(2013CB328904);四川省科技厅应用基础项目(2013JY0035)资助~~ |
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摘 要: | 采用B3LYP/DZP++的方法研究了第一水化层作用和连续化处理的水溶剂作用对鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对和腺嘌呤-胸腺嘧啶(AT)碱基对质子转移反应的影响.GC和AT碱基对在连续化水溶剂作用下,均发生单质子转移(SPT1)和分步的双质子转移(DPT),而在第一水化层5个水分子的作用下(GC·5H2O,AT·5H2O)或同时考虑第一水化层作用和连续化水溶剂作用(GC·5H2O+PCM,AT·5H2O+PCM)时,GC和AT碱基对的质子转移均只得到单质子转移反应(SPT1).单质子转移过程中的活化能变化情况表明:第一水化层对GC和AT碱基对结构和质子转移影响较大,水环境对碱基对的作用主要发生在第一水化层.
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关 键 词: | 密度泛函理论 碱基对 质子转移 第一水化层 连续化的水溶剂作用 |
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