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靛玉红类CDK1抑制剂的同源模建、分子对接及3D-QSAR研究
引用本文:张青青,姚其正,张生平,毕乐明,周之光,张骥.靛玉红类CDK1抑制剂的同源模建、分子对接及3D-QSAR研究[J].物理化学学报,2014(2).
作者姓名:张青青  姚其正  张生平  毕乐明  周之光  张骥
作者单位:中国药科大学药学院;中国药科大学物理化学教研室;
基金项目:国家“重大新药创制”科技重大专项(2009ZX09103-149)资助~~
摘    要:细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及Discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3D-QSAR)模块(以下简称为DS)分别建立了3D-QSAR模型.其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3D-QSAR模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r2=0.909,r2pred.=0.836;DS:q2=0.579,r2=0.971,r2pred.=0.795,其中q2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数).本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CDK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.

关 键 词:细胞周期蛋白依赖性激酶  靛玉红  D-QSAR  比较分子场分析  同源模建
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