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基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立
引用本文:邢晓清,初亚男,项铮,宋沁馨,周国华.基于克隆测序技术的人类白细胞抗原基因高分辨率分型方法的建立[J].分析化学,2014(11):1574-1579.
作者姓名:邢晓清  初亚男  项铮  宋沁馨  周国华
作者单位:1. 药物质量与安全预警教育部重点实验室,中国药科大学,南京210009; 南京军区南京总医院药理科,南京210002
2. 南京军区南京总医院药理科,南京,210002
基金项目:江苏省科技支撑计划社会发展项目,中国博士后科学基金面上项目,药物质量与安全预警教育部重点实验室资助项目,南京军区南京总医院院内课题
摘    要:运用优化的扩增和克隆测序技术,建立了人类白细胞抗原( HLA-B)基因的高分辨率分型方法。针对HLA-B基因保守区序列设计引物进行等位基因扩增,基于质粒不相容原理将杂合型等位基因有效克隆入质粒DNA中,经细菌培养后进行Sanger测序,根据测序结果经ClustalX2软件分析和IMTG/HLA数据库的BLAST比对即可完成HLA-B基因的高分辨率分型。利用建立的方法对7例临床样本进行了HLA-B基因分型,并且与第三方直接碱基序列分析基因分型技术( PCR-SBT)进行比对,结果完全一致。本方法无需专业分型软件,准确度高,成本低;采用通用引物进行等位基因的扩增和测序,无需传统方法中繁琐的引物设计和过程优化,实现了HLA-B基因的高分辨率分型。

关 键 词:人类白细胞抗原-B基因  克隆测序技术  Sanger测序  高分辨率基因分型

Establishment of Cloning and Sequencing Method for High-Resolution Human Leukocyte Antigen-B Genotype Assay
XING Xiao-Qing , CHU Ya-Nan , XIANG Zheng , SONG Qin-Xin , ZHOU Guo-Hua.Establishment of Cloning and Sequencing Method for High-Resolution Human Leukocyte Antigen-B Genotype Assay[J].Chinese Journal of Analytical Chemistry,2014(11):1574-1579.
Authors:XING Xiao-Qing  CHU Ya-Nan  XIANG Zheng  SONG Qin-Xin  ZHOU Guo-Hua
Abstract:
Keywords:Human leukocyte antigen-B gene  TA clone  Sanger Sequencing  High-resolution genotyping
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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