| 显著性分析(SAM)方法在乳腺癌基因芯片数据分析中的应用 |
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| 引用本文： | 罗亚玲,蒋峥,张世强.显著性分析(SAM)方法在乳腺癌基因芯片数据分析中的应用[J].数学的实践与认识,2015(1):112-118. |
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| 作者姓名： | 罗亚玲 蒋峥 张世强 |
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| 作者单位： | 重庆医科大学数学教研室 |
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| 摘 要： | 对乳腺癌基因芯片试验结果进行数据分析,寻找在正常组织与癌组织中呈现差异表达的基因.运用微阵列芯片显著性分析(SAM)方法进行差异表达基因的筛选,并使用permutation算法计算错误发现率(FDR).一些呈现差异表达的基因被筛选出来,其中一部分基因已被数篇文献报道过,认为它与乳腺癌发病相关.SAM方法比较适用于对基因芯片实验的结果进行相关基因的初步筛选,筛选出的基因可用于为进一步的研究提供候选基因.
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| 关 键 词： | 基因芯片 乳腺癌 permutation检验 显著性分析 SAM |
The Application of Significance Analysis of Microarrays in Data Analysis of Breast Cancer Microarray |
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| LUO Ya-ling;JIANG Zheng;ZHANG Shi-qiang.The Application of Significance Analysis of Microarrays in Data Analysis of Breast Cancer Microarray[J].Mathematics in Practice and Theory,2015(1):112-118. |
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| Authors: | LUO Ya-ling;JIANG Zheng;ZHANG Shi-qiang |
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| Institution: | LUO Ya-ling;JIANG Zheng;ZHANG Shi-qiang;Department of mathematics,Chongqing Medical University; |
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