拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用 |
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引用本文: | 许叶春,沈建华,罗小民,沈旭,陈凯先,蒋华良.拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用[J].中国科学B辑,2004,34(3):177-187. |
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作者姓名: | 许叶春 沈建华 罗小民 沈旭 陈凯先 蒋华良 |
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作者单位: | 中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,新药研究国家重点实验室,药物发现与设计中心,上海,201203 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(20102007,29725203和20072042),国家基础研究重点规划基金(2002CB512802),国家八六三高科技项目(2002AA233011,2002AA233061,2001AA235051和2001AA235041),上海市科技发展基金,中国科学院新药研究和开发重大项目基金资助 |
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摘 要: | 配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理, 为合理药物设计提供线索. 新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟, 从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程. 文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂α-APA解离过程的成功模拟, 综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用.
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关 键 词: | 拉伸分子动力学 配体和受体相互作用研究 分子动力学 |
收稿时间: | 2003-10-27 |
修稿时间: | 2003年10月27 |
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