| 芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟 |
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| 作者姓名： | 李博 刘明 胡文祥 |
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| 作者单位： | Institute of Physical Organic and Medicinal Chemistry, Capital Normal University, Beijing 100048, P. R. China; College of Life Science, Capital Normal University, Beijing 100048, P. R. China |
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| 摘 要： | 采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用AutoDock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用GROMACS程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体蛋白复合物进行了MD模拟研究,优化对接复合物的结构,最后利用MM-PBSA方法,在APBS程序中计算芬太尼类衍生物与阿片μ受体的结合自由能,计算出的受体配合物结合常数(Ki)与其实验值吻合较好,并预测了化合物的活性排序.结果表明,复合物蛋白结构与空载受体蛋白结构有较大差异,特别是胞内区IL2、IL3和跨膜区段TM4骨架构象变化较大,不同的化合物对受体结构影响也有差异,活性较好的化合物会增加蛋白特定区域结构的柔性.芬太尼类化合物可能是通过和受体结合后诱导阿片μ受体构象转变为活性构象,引起一系列的信号传导激活G蛋白,从而引发生理效应.
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| 关 键 词： | 分子动力学 芬太尼 阿片μ受体 分子对接 |
| 收稿时间： | 2009-05-08 |
| 修稿时间： | 2009-09-08 |
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