| 利用PCR-RFLP技术分析拟穴青蟹抗菌肽基因SCY2的SNP位点 |
| |
| 引用本文： | 马洪雨,马春艳,张丹,崔海玉,蒋科技,马凌波. 利用PCR-RFLP技术分析拟穴青蟹抗菌肽基因SCY2的SNP位点[J]. 武汉大学学报(理学版), 2011, 57(4): 343-349 |
| |
| 作者姓名： | 马洪雨 马春艳 张丹 崔海玉 蒋科技 马凌波 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院东海水产研究所／农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海,200090
2. 中国水产科学研究院东海水产研究所／农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海200090／上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31001106); 上海市科委“科技创新行动计划”基础研究重点科技项目(10JC1418600) |
| |
| 摘 要： | 本研究根据公布的锯缘青蟹SCY2基因序列设计引物SCY2-RFLPs和SCY2-RFLPa,利用PCR-RFLP技术分析了5个地理群体（宁德、汕头、万宁、东方、三亚）共计148个拟穴青蟹SCY2基因的多态性.结果表明,所扩增的SCY2基因片段含有2个StuⅠ内切酶识别位点,位于第一外显子的位点没有多态性,位于第一内含子的位点存在多态性.在148个个体中共检测到AA和AB两种基因型,等位基因B的出现频率非常低,只在三亚群体的1个个体中检测到,而在其他4个群体中均未检测到,其等位基因频率为0.003 4.序列分析结果表明,扩增片段长度为1 016 bp,包含部分5′非翻译区（282 bp）、第一外显子（131 bp）和部分第一内含子（603 bp）.AA基因型表现为3条带（从大到小依次为509,356,151 bp）,AB基因型表现为4条带（从大到小依次为660,509,356,151bp）.B等位基因是由于867 bp处发生了C→G的单碱基突变导致StuⅠ内切酶失去了1个识别位点而形成的.
|
| 关 键 词： | 拟穴青蟹 SCY2基因 PCR-RFLP技术 单核苷酸多态性(SNP) |
Analysis of SNP Loci of Antimicrobial Peptide SCY2 Gene in Scylla paramamosain by PCR-RFLP Assay |
| |
| MA Hongyu,MA Chunyan,ZHANG Dan,,CUI Haiyu,JIANG Keji,MA Lingbo. Analysis of SNP Loci of Antimicrobial Peptide SCY2 Gene in Scylla paramamosain by PCR-RFLP Assay[J]. JOurnal of Wuhan University:Natural Science Edition, 2011, 57(4): 343-349 |
| |
| Authors: | MA Hongyu MA Chunyan ZHANG Dan CUI Haiyu JIANG Keji MA Lingbo |
| |
| Affiliation: | MA Hongyu1,MA Chunyan1,ZHANG Dan1,2,CUI Haiyu1,JIANG Keji1,MA Lingbo1(1.East China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences/Key Laboratory of Marine and Estuarine Fisheries Resources and Ecology,Ministry of Agriculture,Shanghai 200090,China,2.College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China) |
| |
| Abstract: | The anionic antimicrobial peptide SCY2 gene was recently reported only expressing in gonad tissue of male Scylla serrata.The single nucleotide polymorphisms(SNPs) of functional gene are thought to be potential useful molecular markers for assisting breeding.In the present study,one pair of primers(SCY2-RFLPs and SCY2-RFLPa) was designed according to the gene SCY2 of Scylla serrata firstly,and then the genetic diversity of this gene of five different geographic populations(Ningde,Shantou,Wanning,Dongfang and... |
| |
| Keywords: | Scylla paramamosain SCY2 gene polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) single nucleotide polymorphism(SNP) |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
