| 凡纳滨对虾亲环素A基因的克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 丁兆坤,辛文伦,陈秀荔,赵永贞,许友卿,陈晓汉.凡纳滨对虾亲环素A基因的克隆及表达分析[J].武汉大学学报(理学版),2011,57(4). |
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| 作者姓名： | 丁兆坤 辛文伦 陈秀荔 赵永贞 许友卿 陈晓汉 |
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| 作者单位： | 1. 广西大学水产科学研究所,广西南宁,530004
2. 广西水产研究所广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁,530021 |
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| 基金项目： | 农业部现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-47); 广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2060302CXIF-2009-02); 广西壮族自治区自然科学基金项目(桂科基0836028桂科自0832009Z) |
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| 摘 要： | 通过电子克隆所得基因序列设计引物,采用RT-PCR方法首次克隆得到长度为885 bp的凡纳滨对虾亲环素A（Cyclophilins A）CYPA基因cDNA序列,其开放阅读框为35~529 bp,可编码164个氨基酸.推算其分子量约为17.6×103,理论等电点为8.55.与其他物种的CYPA基因比对发现,该基因的氨基酸序列具有较高的保守性.基于氨基酸序列的聚类分析表明,凡纳滨对虾与斑节对虾的亲缘关系最近.荧光定量PCR的结果显示该基因在组织中广谱表达,在抗病组中,胃中的表达量最高,心脏中的表达量最低,差异约为2倍.而在感病组中,该基因在心脏中的表达量最高,肌肉中的表达量最低.利用ProtFun在线预测蛋白质的功能分类,表明CYPA基因可能是一免疫应答抑制因子,参与凡纳滨对虾免疫防御反应.
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| 关 键 词： | 凡纳滨对虾 亲环素A 克隆 荧光定量PCR |
Cloning and Expression Analysis of Cyclophilins A Gene from Litopenaeus vannamei |
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| DING Zhaokun,XIN Wenlun,CHEN Xiuli,ZHAO Yongzhen,XU Youqing,CHEN Xiaohan.Cloning and Expression Analysis of Cyclophilins A Gene from Litopenaeus vannamei[J].JOurnal of Wuhan University:Natural Science Edition,2011,57(4). |
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| Authors: | DING Zhaokun XIN Wenlun CHEN Xiuli ZHAO Yongzhen XU Youqing CHEN Xiaohan |
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| Institution: | DING Zhaokun1,XIN Wenlun1,CHEN Xiuli2,ZHAO Yongzhen2,XU Youqing1,CHEN Xiaohan2(1.Institute for Fishery Sciences,Guangxi University,Nanning 530004,Guangxi,China,2.Guangxi Key Laboratory of Aquatic Genetic Breeding and Healthy Aquaculture,Guangxi Instituteof Fisheries,Nanning 530021,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Litopenaeus vannamei cyclophilin A clone RT-PCR |
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