基于DNA “Y”型结构的指数型核酸恒温扩增策略检测microRNA |
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引用本文: | 郑旭玲,殷文,陈俊,李裕,戴宗,邹小勇.基于DNA “Y”型结构的指数型核酸恒温扩增策略检测microRNA[J].分析测试学报,2021,40(6):920-927. |
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作者姓名: | 郑旭玲 殷文 陈俊 李裕 戴宗 邹小勇 |
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作者单位: | 1.中山大学化学学院,广东广州510275;2.中山大学生物医学工程学院,广东广州510006;3.南方医科大学药学院,广东广州510515 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(21775169,21801259,21974153) |
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摘 要: | 该文基于“Y”型DNA模板和恒温指数扩增反应(EXPAR)技术的信号放大功能,建立了一种快速低序列依赖性的miRNA检测方法(Y-EXPAR)。以let-7b为检测目标,设计两条部分互补的DNA模板,与目标miRNA共同构成“Y”型结构,能够同时进行双向扩增,反应效率高,反应时间短,并降低了放大性能对模板序列的依赖。方法检出限低至0.3 amol/L(相当于10 μL溶液中有1.8拷贝的let-7b),并能区分单碱基差异的let-7家族同源序列。应用于肿瘤细胞裂解液let-7b的检测,POI值与细胞数目对数值呈线性关系,说明Y-EXPAR在实际样品miRNA的检测中具有优势。得益于扩增的高特异性、抗干扰性和低序列依赖性,该方法为miRNA的快速检测提供了新思路,在miRNA相关的疾病研究和临床诊断方面具有良好应用前景。
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关 键 词: | miRNA 恒温指数扩增反应(EXPAR) 序列依赖性 疾病诊断 |
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