| 基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响 |
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| 引用本文： | 张俊娥,邓华锋,郑文强,江京,金聪,赵夫凯.基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响[J].江西师范大学学报(自然科学版),2015,0(6):570-574. |
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| 作者姓名： | 张俊娥 邓华锋 郑文强 江京 金聪 赵夫凯 |
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| 作者单位： | 1.江西师范大学生命科学学院,江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室,江西 南昌 330022)
2.江西师范大学计算机信息工程学院,江西 南昌 330022 |
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| 摘 要： | 利用Illumina HiSeq 2500平台对光暗培养的杜仲愈伤组织进行了转录组高通量测序,利用BLAST软件进行差异表达基因的功能注释和富集分析,就白光(光强为12 000 lux,16 h 光照,8 h 黑暗)对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响进行了研究.结果表明:通过Trinity软件合并组装后共获得62 030个Unigenes,通过BLASTX比对,共获得25 417(40.98%)个有注释信息的Unigenes.通过对KEGG通路进行深入分析表明,白光(光强为12 000 lux,16 h 光照,8 h 黑暗)培养杜仲愈伤组织18 d,与绿原酸合成相关的3种酶基因上调表达,它们分别为苯丙氨酸解氨酶(EC 4.3.1.24,phenylalanine ammonia-lyase,PAL)、肉桂酸-4-羟基化酶(EC 1.14.13.11,trans-cinnamate 4-monooxygenase,C4H)、奎宁酸羟基肉桂酰转移酶(EC 2.3.1.133,Shikimate o-hydroxyl-cinnamoyltransferase,HCT).由此推断,白光能促进杜仲愈伤组织中绿原酸的积累.研究结果为获取高产绿原酸资源和杜仲遗传分析提供有价值的资料.
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| 关 键 词： | 杜仲 愈伤组织 白光 绿原酸 转录组高通量测序 |
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