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模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展
引用本文:吴晓敏,袁晓辉,薛书蕾,查岭生,王光利,张海军. 模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展[J]. 物理化学学报, 2013, 29(9): 1842-1850. DOI: 10.3866/PKU.WHXB201307011
作者姓名:吴晓敏  袁晓辉  薛书蕾  查岭生  王光利  张海军
作者单位:1.Key Laboratory of Resource and Plant Biology of Anhui Province, College of Life Science, Huaibei Normal University, Huaibei 235000, Anhui Province, P. R. China;2.National Local Joint Engineering Laboratory of Bio-resource Ecological Utilization, Northeast Forestry University, Harbin 150040, P. R. China;3.Institute of Biomedicine, Jinan University, Guangzhou 510632, P. R. China
基金项目:国家自然科学基金(81272377,31100083);安徽省自然科学基金(1208085QC58);安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2012B163,2012SQRL225);淮北师范大学引进人才基金(600698)资助~~
摘    要:蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之一, 理解蛋白质结构折叠机制及其与生物功能之间的相互关系一直是生命科学家非常重要的研究内容, 并且该研究受到越来越多不同学科领域研究工作者的高度重视. 蛋白质大多数在数十毫秒、微秒或几秒内完成自我折叠过程, 但其折叠过程中所发生的分子结构精细转变却在纳秒甚至更短时间尺度内完成. 由于其折叠时间分辨率的限制, 目前无论是从常规实验还是理论计算角度对其研究都存在一定的难度. 本文首先概述了蛋白质折叠研究在实验和理论模拟方面存在的一些问题,然后以结构典型且可快速折叠的人工设计多肽Trp-cage为例,主要对其折叠过渡温度、折叠形成模型及其肽链上关键氨基酸残基在折叠过程中的作用三个方面进行了详细讨论, 综述了模型多肽Trp-cage的折叠动力学行为分别在实验和理论模拟方面的研究进展. 最后就如何有效化解蛋白质残基间相互作用网络进而降低其折叠机制的复杂性提出了一些新的建议, 不仅有助于阐明该迷你蛋白Trp-cage快速折叠、稳定形成的驱动力成因, 而且也能为蛋白质折叠机制研究和多肽设计提供有益参考.

关 键 词:实验与理论模拟  折叠机制  过渡温度  残基突变  关键氨基酸  
收稿时间:2013-02-26
修稿时间:2013-07-01

Research Progress of the Trp-Cage Formation and Its Folding Mechanism
WU Xiao-Min;YUAN Xiao-Hui;XUE Shu-Lei;ZHA Ling-Sheng;WANG Guang-Li;ZHANG Hai-Jun. Research Progress of the Trp-Cage Formation and Its Folding Mechanism[J]. Acta Physico-Chimica Sinica, 2013, 29(9): 1842-1850. DOI: 10.3866/PKU.WHXB201307011
Authors:WU Xiao-Min  YUAN Xiao-Hui  XUE Shu-Lei  ZHA Ling-Sheng  WANG Guang-Li  ZHANG Hai-Jun
Affiliation:1.Key Laboratory of Resource and Plant Biology of Anhui Province, College of Life Science, Huaibei Normal University, Huaibei 235000, Anhui Province, P. R. China;2.National Local Joint Engineering Laboratory of Bio-resource Ecological Utilization, Northeast Forestry University, Harbin 150040, P. R. China;3.Institute of Biomedicine, Jinan University, Guangzhou 510632, P. R. China
Abstract:
Keywords:Experimental and theoretical simulation  Folding mechanism  Transition temperature  Residue mutation  Key residue
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