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具核梭杆菌具核亚种蛋白质组及其在癌症pH环境下的差异蛋白质组分析
引用本文:殷薛飞,刘晓慧,申华莉,金红,杨芃原.具核梭杆菌具核亚种蛋白质组及其在癌症pH环境下的差异蛋白质组分析[J].化学学报,2015,73(4):337-342.
作者姓名:殷薛飞  刘晓慧  申华莉  金红  杨芃原
作者单位:a 复旦大学化学系 上海 200433; b 复旦大学生物医学研究院 上海 200032
基金项目:项目受863计划(No. 2012AA020201), 国家"211工程"项目高等学校仪器设备和优质资源共享系统(cers-1-66), 高等学校博士学科点专项科研基金(No. 20130071140007)资助.
摘    要:利用LC-MS/MS对F. nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究, 共鉴定到1198个蛋白质的表达, 占基因组58%的编码基因. 通过在pH 6.5(癌症组织pH环境)和pH 7.5(正常组织pH环境)两种条件下F. nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析, 发现处于癌症微环境pH条件下蛋白质表达的变化明显集中于金属离子转运, 硫胺素代谢, 糖代谢等过程和功能. 产丁酸发酵的能量代谢通路中的七个代谢酶在蛋白质组数据中找到, 其中有五个在癌症pH条件下显著下调, 这五个酶包含了丁酸盐代谢的整个过程, 这为结直肠癌患者肠道丁酸盐含量降低提供了新的证明. 此外, 癌症pH条件下F. nucleatum的丁酸代谢受到抑制, 造成产丁酸能力下降, 可能是其促进结直肠癌发展在代谢水平上的原因之一.

关 键 词:具核梭杆菌  蛋白质组  非标定量  pH环境  丁酸代谢  

Whole Proteome of Fusobacterium nucleatum and Quantitative Analysis of Proteomic Change in Cancer Environment
Yin Xuefei,Liu Xiaohui,Shen Huali,Jin Hong,Yang Pengyuan.Whole Proteome of Fusobacterium nucleatum and Quantitative Analysis of Proteomic Change in Cancer Environment[J].Acta Chimica Sinica,2015,73(4):337-342.
Authors:Yin Xuefei  Liu Xiaohui  Shen Huali  Jin Hong  Yang Pengyuan
Institution:a Department of Chemistry, Fudan University, Shanghai 200433; b Institute of Biomedical Science, Fudan University, Shanghai 200032
Abstract:
Keywords:Fusobacterium nucleatum  proteome  label free quantification  pH condition  butyric acid fermentation
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