| 基于遗传算法和模拟退火的插值马氏模型用于真核生物启动子识别 |
| |
| 引用本文： | 罗强,杨文强,刘普寅.基于遗传算法和模拟退火的插值马氏模型用于真核生物启动子识别[J].模糊系统与数学,2004,18(Z1):370-375. |
| |
| 作者姓名： | 罗强 杨文强 刘普寅 |
| |
| 作者单位： | 国防科学技术大学数学系,湖南,长沙,410043 |
| |
| 基金项目： | 国家自然基金资助项目(No.60375023).资助项目(102028) |
| |
| 摘 要： | 启动子识别是生物信息学领域极具挑战的问题.本文在IMC(Interpolated Markov Chin)的框架下考虑碱基的插入与缺失,采用SA(Simulated Annealing)训练转移概率,以增加模型的鲁棒性,利用GA(Genetic Algorithm)优化IMC插值系数,以克服梯度算法易于陷入局部极值点的缺陷,最后将该模型用于启动子识别,识别率在测试集达到86%.
|
| 关 键 词： | 启动子识别 插值马氏模型(IMC) 遗传算法(GA) 模拟退火算法(SA) |
| 文章编号： | 1001-7402(2004)ZJ-0370-06 |
| 修稿时间： | 2004年6月4日 |
Genetic Algorithm and Simulated Annealing Based Interpolated Markov Chains for Eukaryotic Promoter Recognition |
| |
| LUO Qiang,YANG Wen-Qiang,LIU Pu-yin.Genetic Algorithm and Simulated Annealing Based Interpolated Markov Chains for Eukaryotic Promoter Recognition[J].Fuzzy Systems and Mathematics,2004,18(Z1):370-375. |
| |
| Authors: | LUO Qiang YANG Wen-Qiang LIU Pu-yin |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
