| 甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性 |
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| 引用本文： | 蔡开聪,郑轩,刘亚男,留珊红,杜芬芬.甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性[J].物理化学学报,2016,32(5):1289-1296. |
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| 作者姓名： | 蔡开聪 郑轩 刘亚男 留珊红 杜芬芬 |
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| 作者单位： | 1 福建师范大学化学与化工学院,福州3500072 福建省理论与计算化学重点实验室,福建厦门361005 |
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| 基金项目： | the National Natural Science Foundation of China(21103021);Education Department of Fujian Province of China(JA13063) |
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| 摘 要： | 系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带的振动光谱参数,建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中,与酰胺-Ⅰ带在气/液相中的频率差相关联,并引入酰胺-Ⅰ带简正模式随二级结构变化的规律,将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内,构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图,实现溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ带的快速准确预测。
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| 关 键 词： | 甘氨酸二肽 酰胺-Ⅰ带 振动光谱 静电频率图 |
| 收稿时间： | 2015-12-24 |
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